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新型 ctDNA 液體活檢方法用于癌癥預(yù)后監(jiān)測,性能大幅提升!Science 子刊
時間:2019-08-12 來源:

新型 ctDNA 液體活檢方法用于癌癥預(yù)后監(jiān)測,,性能大幅提升,!Science 子刊


近年來,基于 ctDNA 的液體活檢技術(shù)提供了一種發(fā)現(xiàn)腫瘤并分析腫瘤基因突變的非侵入性手段,并在腫瘤治療反應(yīng)監(jiān)測等領(lǐng)域展示出廣闊的應(yīng)用前景,。但目前,,在血液中檢測微量腫瘤 DNA 仍然存在諸多挑戰(zhàn),尤其是對于那些已經(jīng)接受過初期化療的患者,。對于非轉(zhuǎn)移性癌癥患者,,大多數(shù)現(xiàn)有方法對治療期間或治療結(jié)束后的殘留病灶檢測仍然缺乏足夠的敏感性。

為了解決以上這些問題,,來自美國希望之城轉(zhuǎn)化基因組學(xué)研究所(TGen),、梅奧醫(yī)學(xué)中心及英國劍橋大學(xué)的研究團隊日前開發(fā)出一種名為“TARDIS”(TARgeted DIgital Sequencing)的新型乳腺癌液體活檢方法。該方法可以準確分析乳腺癌患者在新輔助治療期間的殘留病灶,,進而幫助患者避免不必要的手術(shù),,使醫(yī)生能夠?qū)Π┌Y進行持續(xù)、精確的監(jiān)測,。值得關(guān)注的是,,這種檢測方法較其他基于血液的癌癥監(jiān)測手段敏感 100 倍。研究人員在論文中寫到,,TARDIS 在目前使用臨床相關(guān)血量進行 ctDNA 檢測的極限基礎(chǔ)上,,實現(xiàn)了 100 倍以上的改進,證明了個性化的 ctDNA 監(jiān)測可以實現(xiàn)對癌癥患者的個體化臨床管理,。相關(guān)文章于今日發(fā)表在 Science Translational Medicine 期刊,。


圖:TARDIS 文庫制備示意圖
“腫瘤釋放到血液中的 ctDNA 片段與腫瘤細胞具有相同的癌癥特異性突變,這為我們提供了一種檢測腫瘤的方法,。但問題是非轉(zhuǎn)移性癌癥患者的 ctDNA 水平可能非常低,,單個血液樣本中通常沒有足夠的 ctDNA 片段用于可靠地檢測任何一個突變。在治療期間或治療后沒有明顯腫瘤殘留的情況下尤為如此,?!闭撐牡谝蛔髡?Bradon McDonald 介紹,“因此,,我們決定整合每位患者的數(shù)十種基因突變結(jié)果,,而不是關(guān)注每位患者的單一突變?!?/span>

研究結(jié)果表明,,使用 TARDIS 進行個性化 ctDNA 分析具有良好應(yīng)用前景。在參考樣本中,,通過同時分析 8 到 16 個已知突變,,TARDIS 在突變等位基因比率(AF)上分別具有 91% 和 53% 的靈敏度(96% 特異性,使用相當于一管血的 input DNA),。進一步分析來自 33 名患有 I~III 期乳腺癌女性患者 80 份血漿樣本中的 115 個突變,,數(shù)據(jù)顯示,,在治療前,TARDIS 在所有患者中檢測到 ctDNA,,中位 AF 為 0.11%,。完成新輔助治療后,與殘留病灶患者相比,,獲得病理完全緩解(pathCR)的患者 ctDNA 濃度較低(中位 AF 分別為 0.017% 和 0.003,,P=0.0057,AUC=0.83),。此外,,在新輔助治療期間,病理完全緩解患者的 ctDNA 濃度有較大的下降,。這些結(jié)果證明了 ctDNA 分析在新輔助治療期間評估殘留病灶的高準確度,。


圖:論文通訊作者 Muhammed Murtaza
“我們研究的核心前提是,我們能否開發(fā)出一種血液檢測方法,,能夠?qū)⑼耆斡幕颊吲c帶有殘留病灶的患者區(qū)分開來,。”論文通訊作者,、TGen 非侵入性診斷中心助理教授 Muhammed Murtaza 表示,,“通過精準檢測 ctDNA,該方法可以發(fā)現(xiàn)殘余癌癥的存在,,并告知醫(yī)生治療是否成功地根除了癌癥,。”例如,,TARDIS 足夠精確,,可以判斷早期乳腺癌患者對術(shù)前藥物治療的反應(yīng)是否良好。它比目前使用影像學(xué)確定藥物治療反應(yīng)的方法更為敏感,。這些檢測結(jié)果可以用于個體化癌癥治療,,避免在某些情況下過度治療,而在另一些情況下治療不徹底,。
“這對患有乳腺癌的女性來說意義重大,。這項檢測可以幫助制定患者在接受術(shù)前治療后手術(shù)切除和放射治療的時間和范圍?!闭撐墓餐ㄓ嵶髡?、梅奧醫(yī)學(xué)中心腫瘤外科學(xué)家 Barbara A. Pockaj 強調(diào)。
此外,,TARDIS 是一種液體活檢方法,,只需進行簡單的抽血,因此可以根據(jù)需要安全地重復(fù)進行,,以檢測患者的疾病狀況,。
研究人員表示,,經(jīng)過進一步的臨床試驗與驗證,TARDIS 將有望被常規(guī)應(yīng)用于乳腺癌治療期間的患者監(jiān)測,,幫助發(fā)現(xiàn)患者確定何時基本治愈癌癥。目前 TGen 正在尋找合作伙伴,,以實現(xiàn) TARDIS 的商業(yè)運作,。
參考資料:
1.Personalized circulating tumor DNA analysis to detect residual disease after neoadjuvant therapy in breast cancer

2. NEW‘LIQUID BIOPSY’BLOOD TEST IMPROVES BREAST CANCER DIAGNOSTICS

來源:測序中國

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